Ang "Mahiwagang Kuba" ay isang solidong nobela na may malalim na kaisipan at mga tema na may kaugnayan sa lipunan, kultura, at politika ng Pilipinas noong panahon ng mga Espanyol. Ang nobela ay naglalahad ng mga pagbabago na kinakailangan sa lipunan ng Pilipinas at ang mga epekto ng mga abuso ng mga Espanyol sa mga Pilipino.

Ang "Ang Mahiwagang Kuba" ay hindi isang tipikal na fairy tale. Ito ay isang makabagbag-damdaming salaysay na umiikot sa pag-ibig, panghuhusga sa panlabas na anyo, at ang kapangyarihan ng kabutihang-loob.